В случае уплаты налога на доходы физических лиц не по месту нахождения обособленного подразделения, а по месту нахождения головной организации речь не идет о нарушении сроков уплаты налога. Статья 75 НК РФ не содержит положений, предусматривающих зависимость начисления пеней от порядка распределения сумм налогов между бюджетами разных уровней.
Согласно судебной практике подобное нарушение не влечет за собой начисление пеней. Начисление пеней возможно только в случае, если у налогоплательщика имеется фактическая задолженность перед бюджетом.
Кроме того, близкую к судебной практике позицию об отсутствии оснований для начисления пеней занимает Минфин России (письмо Минфина России от 10.10.2014 № 03-04-06/51010). Начисление пеней в данном случае неправомерно.
