В письме от 08.05.2015 № 03-03-06/1/26918 указано, что командировочное удостоверение с отметками принимающей организации о прибытии в место командирования и убытии из него подтверждает факт нахождения работника в месте командирования, но не определяет факт несения работником расходов на проезд и размер таких расходов. Кроме того, с учетом изменений, внесенных в законодательство, обязанность оформления работодателем командировочного удостоверения для командированного работника отсутствует.
Таким образом, при отсутствии документов, подтверждающих расходы сотрудника организации на проезд до места командирования и обратно, суммы возмещения организацией-работодателем таких расходов подлежат обложению НДФЛ в установленном порядке.
На основании статьи 252 НК РФ и в соответствии с положениями федерального закона от 06.12.2011 № 402-ФЗ «О бухгалтерском учете» при отсутствии документов, подтверждающих расходы сотрудника организации на проезд до места командирования и обратно, налогоплательщик не вправе признать указанные расходы для целей налогообложения прибыли организаций.
В письме от 06.05.2015 № 03-03-06/1/26251 отмечается, что в случае проезда работника к месту командирования и обратно к месту работы на транспорте сторонней автотранспортной организации, оказывающей налогоплательщику услуги по перевозке сотрудника, подтверждением фактического срока пребывания работника в служебной командировке, а также использования указанного транспорта, могут являться любые первичные документы, оформленные в соответствии с законодательством Российской Федерации, которые свидетельствуют о фактическом нахождении работника в пути к месту командирования и обратно на указанном транспорте.