Поскольку приказ ФНС России от 04.03.2015 № ММВ-7-6/93@, которым утвержден новый формат журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, еще не прошел регистрацию в Минюсте России, исполнение обязанности по представлению журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур в электронном виде допускается как по формату, утвержденному приказом ФНС России от 05.03.2012 № ММВ-7-6/138@ так и по формату, утвержденному приказом ФНС России от 04.03.2015 № ММВ-7-6/93@, размещенному на Интранет-портале ФНС России в разделе информации Управления информационных технологий ФНС России — АСК НДС-2 — Работа с налогоплательщиками.
Перечень категорий налогоплательщиков, на которых распространяется обязанность представлять журнал учета полученных и выставленных счетов-фактур, предусмотрен пунктом 5.2 статьи 174 НК РФ.
В письме ФНС России от 08.04.2015 № ГД-4-3/5880 разъяснено, что лица, не являющиеся налогоплательщиками НДС, налогоплательщики, освобожденные от исполнения обязанностей налогоплательщика, не признаваемые налоговыми агентами, в случае осуществления предпринимательской деятельности на основе договоров комиссии, агентских договоров, договоров транспортной экспедиции, а также при выполнении функций застройщика, обязаны, начиная с налогового периода за первый квартал 2015 года, представить в налоговый орган в срок не позднее 20-го числа месяца, следующего за истекшим налоговым периодом журнал учета полученных и выставленных счетов-фактур в соответствии с Приложением 3 к приказу ФНС России от 04.03.2015 № ММВ-7-6/93@.
При этом представление вышеуказанными лицами журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур осуществляется в рамках документооборота по представлению отдельных документов в налоговые органы (12 ДО), утвержденного приказом ФНС России 09.11.2010 № ММВ-7-6/535@, с применением описи документов, утвержденной приказом ФНС России от 29.06.2012 № ММВ-7-6/465@.