При оказании казенным учреждением на договорной основе платных услуг, не отнесенных к государственным (муниципальным) услугам, доходы и расходы от оказания данных услуг учитываются для целей налогообложения прибыли в общеустановленном порядке.
Что касается налога на добавленную стоимость, то согласно разъяснениям Минфина оказание услуг казенными учреждениями не признается объектом налогообложения НДС в любом случае.